داستان فیلم «ماریوس» در بندر قدیمی مارسی و در کافه «لا مارین» می‌گذرد که متعلق به سزار و پسرش ماریوس است. بزرگ‌ترین رویای ماریوس این است که سوار بر یکی از کشتی‌هایی که از مقابل کافه پدرش می‌گذرند، به سرزمینی دوردست سفر کند. فانی، دختر جوان و زیبای صدف‌فروش، از دوران کودکی مخفیانه عاشق ماریوس بوده است؛ ماریوس نیز با وجود اینکه هرگز اعتراف نکرده، همیشه فانی را دوست داشته است. یک روز، دریانوردی به کافه می‌آید و به ماریوس کاری در یک کشتی اکتشافی پیشنهاد می‌دهد. فانی برای نگه داشتن او و ایجاد حسادت، عشق خود را به او اعتراف می‌کند و باعث دعوا بین ماریوس و یکی از دوستان قدیمی سزار به نام پانیس می‌شود؛ تاجر کشتی مسنی که مدتی است از فانی خواستگاری می‌کند. ماریوس که میان ندای دریا و عشقش به فانی مردد مانده، رویای خود را رها می‌کند تا با فانی باشد. اما در حالی که سزار و اونورین، مادر فانی، خود را برای عروسی آماده می‌کنند، ماریوس نظرش تغییر می‌کند و دوباره مجذوب ندای دریا می‌شود.

«فانی» بخش دوم از «سه‌گانه مارسی» است که توسط مارسل پانیول با نام عمومی «ماریوس، فانی و سزار» ساخته شده است. فانی عاشق ماریوس می‌شود اما ماریوس او را ترک می‌کند. حالا او متوجه می‌شود که باردار است. مادرش و پدر ماریوس، سزار، او را متقاعد می‌کنند که خواستگاری مردی بسیار مسن‌تر را بپذیرد. فانی برای حفظ آبرو، می‌پذیرد با اونوره پانیس، تاجر ثروتمند بندر قدیمی که ۳۰ سال از او بزرگ‌تر است ازدواج کند، مردی که پسر او را به فرزندی قبول خواهد کرد.